Cursurile oferite de Institutul Teologic Timotheus, in cei patru ani de studii, asigura studentului o dezvoltare spirituala si academica complexa si il echipeaza pentru a face lucrarea lui Dumnezeu cu dedicare, eficient si pentru gloria Domnului Isus Cristos. Printre aceste cursuri se regasesc:
- Studiul Vechiului Testament SVT111; SVT121; SVT 211; SVT 221;
- Studiul Noului Testament SNT 111; SNT 121; SNT 211; SNT 221;
- Limba Ebraică LEB 211; LEB 221; LEB 312; LEB 322;
- Limba Greacă LGR 111; LGR 121; LGR 211; LGR 221;
- Teologia Biblică a Vechiului Testament TBV 321;
- Teologia Biblică a Noului Testament TBN 311;
- Hermeneutică HER 111; HER 121;
- Homiletică HOM 211; HOM 221; HOM 311; HOM 321;
- Teologie sistematică și dogmatică Creștină după Evanghelie TSD 311; TSD 321; TSD 411; TSD 421;
- Spiritualitate si viata crestina SVC 111; SVC 121;
- Istoria Bisericii universale IBU 111; IBU 121;
- Istoria Bisericii Crestine dupa Evanghelie IBC 122;
- Istoria si filosofia religiilor IFR 211; IFR 221;
- Istoria gândirii crestine IGC 311; IGC 321;
- Teologia închinării si muzica bisericeasca TIM 211; TIM 221;
- Etica crestina ETC 411;
- Administratie si contabilitate bisericeasca ACB 411; ACB 421;
- Drept bisericesc DRB 411; DRB 421;
- Limba Engleza LEN 111; LEN 121; LEN 211; LEN 221;
- Teologia slujirii pastorale TSP 411; TSP 421;
- Misiologie si formare misionara MFM 311; MFM 321;
- Conducerea Bisericii COB 311; COB 321;
- Consiliere pastorala CPA 411; CPA 421;
- Apologetica APC 411; APC 421;
- Practica pastorala PPA 111;
- Limba Româna contemporana LRC 111; LRC 121;
- Metodologia cercetarii stiintifice de profil MCS 411; MCS 421;
- Istorie și civilizație ebraică ICE 111;
- Exegeza Noului Testament ENT 312;
- Exegeza Vechiului Testament EVT 322;
- Retorica RET 212; RET 222;
- Pedagogie PED 312; PED 322;
- Practica pedagogica PPD 412; PPD 422;